Năm 1999, Bộ Quốc phòng giao Bộ Tư lệnh công binh khảo sát và xây dựng hạ tầng trên đảo Hòn Hải. Việc xây dựng được thực thi bởi Đoàn công tác của công binh, Đoàn đo đạc biên vẽ hải đồ và nghiên cứu biển thuộc Quân chủng Hải quân.[4]

Tháng 3 năm 2002, các công trình cơ sở hạ tầng trên đảo được bắt đầu xây dựng.[4] Cuối năm 2004,[4] trạm hải đăng Hòn Hải xây xong và được chuyển giao cho Công ty bảo đảm Hàng hải khu vực III, nay là Tổng công ty bảo đảm an toàn Hàng hải Nam Trung Bộ thuộc Bộ Giao thông Vận tải quản lý và vận hành.[8] Tháng 5 năm 2005, việc xây dựng cơ sở hạ tầng trên đảo hoàn tất.[4] Trên đảo có 2 ngôi mộ gió của 2 người lính đã thiệt mạng trong quá trình xây dựng.[4]

Năm 2012, trạm tiếp sóng của Viettel được xây dựng, các thiết bị chạy bằng dàn pin năng lượng Mặt trời.[12]

Vào tháng 6 năm 2017, bia đánh dấu chủ quyền Cột mốc A6 được xây dựng.[10]